graphpad prism显著性差异分析

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graphpad prism显著性差异分析

2024-07-11 07:47| 来源: 网络整理| 查看: 265

文章来源:解螺旋 (ID:HelixLife)

GraphPad Prism 是一款高效易用的科研绘图工具,集生物统计、曲线拟合和科技绘图于一体,还可用于 Windows 和 Mac 操作系统,在生物学以及社会和物理科学界得到广泛使用。

事物都在不断发展与进步, 2020 年 10 月 30 日,Graphpad 公司隆重推出了 Graphpad Prism 的全新版本 Graphpad Prism 9(以下简称 Prism 9)!

总的来说,Prism 9 与 Prism 8 很相似,很容易上手,所以广大熟练使用 Prism 8 的用户可以无缝对接到 Prism 9。

相同点无需赘述,那么作为最新版本的 Prism 9 新在哪里?接下来就让我们一起来围观 Prism 9 的新功能吧!

一、更加智能,自动添加多结果统计学差异

在某科研论坛上有一个问题,横线表示 p 值,可以在 prism 软件中画出,那每根柱子上面的线表示什么意思,怎么用 Prism 画出来?

在 Prism 9 中只需鼠标单击一次既可自动连线并将统计结果添加到图形中,工作效率得到极大的提高:

使用步骤:

1. 打开 Prism 9,New table & graph 选择 Column,输入示例数据:

2. Graphs 下选择柱形图加散点,得到基本图形如下:

3. 点击 Analyze,对两组数据进行相应的统计学分析,此处进行 t 检验,点击 OK 完成统计:

4. 点击 Draw 下带红色星号(*)的划线工具,即可自动添加连线与统计差异:

双击该工具可以对显示的颜色等信息进行设置,例如 Display options 可以设置显示具体的 p 值或星号,Line/bracket and text options 可以设置组间连线的粗细及颜色等。此外对存在显著性差异的 p 值阈值进行设置 ——P value threshold:

单因素方差分析的自动标记方法与前述类似:

有一个小问题,如果我不想显示没有差异的比较该怎么办?

那么请双击自动划线工具,点击 Comparisons on graph,不勾选不想显示的比较两组,即可去除画线与 ns:

二、新的图形,气泡图和评估图

气泡图(bubble plot):可显示多元变量数据,可清晰的呈现多个数据之间的关系。例如,下图显示了 X、Y, 气泡大小与颜色多元变量之间的关系:

基本步骤为:

1. 打开 Prism 9,New table & graph 选择 Multiple variables,输入数据:

 2. 在 Create New Graph 下的 Kind of show 选择 Bubble Plot,分别选择 X 轴、Y 轴、气泡大小与颜色对应的变量,点击 OK 即可得到气泡图,后续进行美化与调整:

3. 双击气泡进入 Format Graph, Fill Color 中 Prism 9 提供了多种配色方案:Plasma、Viridis、Magma 等。

从 t 检验生成评估图(estimation plot):该图形左侧散点显示了 Male 与 Female 的原始数据,右侧显示了效应量(平均数差值)及其 95% 置信区间的大小。

如下图所示:如果效应量 95% Cl 包括 0 则 p>0.05,如 95% Cl 不包括 0,则 p



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